Τις αντιρρήσεις του για το σχέδιο «Αθηνά», στο οποίο διαπιστώνει «μόνο αρνητικές πλευρές», διατυπώνει με ψήφισμα της συνέλευσής του και το Τμήμα Βαλκανικών, Σλαβικών και Ανατολικών Σπουδών του Πανεπιστημίου Μακεδονίας, ένα από τα πανεπιστημιακά τμήματα της Θεσσαλονίκης που επηρεάζονται σοβαρότερα από τους σχεδιασμούς του υπουργείου Παιδείας, καθώς απειλείται το ίδιο το γνωστικό του αντικείμενο, αλλά και η στήριξη της ελληνικής εξωτερικής πολιτικής και επιχειρηματικής δραστηριότητας στα Βαλκάνια με εξειδικευμένα στελέχη.
Σύμφωνα με το σχέδιο, το τμήμα, μαζί με το αντίστοιχο του Πανεπιστημίου Δ. Μακεδονίας (Φλώρινα), συγχωνεύονται με το Τμήμα Διεθνών και Ευρωπαϊκών Σπουδών, σε μια ενιαία σχολή μαζί με το Τμήμα Εκπαιδευτικής και Κοινωνικής Πολιτικής. Αποτέλεσμα αυτών των διαδοχικών συγχωνεύσεων θα είναι η δημιουργία ενός υδροκέφαλου τμήματος με 56 μέλη ΔΕΠ, που θα προσφέρει περί τα 235 μαθήματα σε έναν τεράστιο αριθμό φοιτητών. Με τον τρόπο αυτό, ουσιαστικά, ο τίτλος των Βαλκανικών Σπουδών σβήνεται από τον χάρτη των ΑΕΙ της χώρας, κάτι που θα έχει ως αποτέλεσμα την υποβάθμιση των τίτλων των αποφοίτων και ένα σοβαρό πλήγμα στο μέλλον της διδασκαλίας των γλωσσών της περιοχής στο Πανεπιστήμιο.
Ταυτόχρονα, το ψήφισμα της Γ.Σ. κατηγορεί το υπουργείο ότι εφαρμόζει δύο μέτρα και δύο σταθμά, καθώς καταργεί όλα τα τμήματα «σπουδών περιοχής» στη Μακεδονία και τη Θράκη, φυσικό σύνορο της Ελλάδας με όλες τις βαλκανικές χώρες (αφού καταργεί και το Τμήμα Παρευξεινίων χωρών στην Κομοτηνή), ενώ σωστά αφήνει ανέπαφα άλλα (π.χ. Μεσογειακών Σπουδών στη Ρόδο) ή συγχωνεύει με διατήρηση των συστατικών τους (π.χ. Σλαβικών, Τουρκικών και Ασιατικών στο ΕΚΠΑ). Ας σημειωθεί ότι το Τμήμα ΒΣΑΣ του Πανεπιστημίου Μακεδονίας στις σχετικές αξιολογήσεις ομοειδών τμημάτων κατατάσσεται πρώτο σε πανελλαδικό επίπεδο.
Αντιδρώντας στις προβλέψεις του σχεδίου «Αθηνά», το τμήμα αντιπροτείνει προς το υπουργείο Παιδείας τη συγχώνευσή του μόνο με το «αδελφό» τμήμα της Φλώρινας, στο πλαίσιο μιας Σχολής Διεθνών και Περιφερειακών Σπουδών.
