Τη στρατιωτικοποίηση του υπουργείου Ναυτιλίας καταγγέλλουν οι πολιτικοί υπάλληλοι, που προσφεύγουν στο ΣτΕ, ενώ παράλληλα προαναγγέλλουν κινητοποιήσεις. Υπογραμμίζοντας πως η κυβέρνηση ετοιμάζει νέες απολύσεις στο όνομα της αξιολόγησης, καταγγέλλουν πως ο Μ. Βαρβιτσιώτης μέσα σε αυτό το πλαίσιο επιχειρεί την περιθωριοποίηση του πολιτικού προσωπικού και "αν είναι δυνατόν και την απομάκρυνσή του από το υπουργείο ταυτιζόμενος στη πράξη με τις υποδείξεις των αποστράτων του Λιμενικού Σώματος". "Μέσα από τον νέο Οργανισμό παραβιάζονται οι διατάξεις του ν. 4150/13 'Ανασυγκρότηση ΥΝΑ' γιατί πιθανώς ο υπουργός Ναυτιλίας και Αιγαίου τις θεωρεί 'αριστερόστροφα μεταπολιτευτικά ιδεολογήματα', όπως του υποδεικνύουν οι συντεχνίες", αναφέρουν χαρακτηριστικά.
Την ίδια στιγμή, ο Πανελλήνιος Σύλλογος Υπαλλήλων του ΥΝΑ υπογραμμίζει ότι με την κάλυψη θέσεων από πολιτικούς υπαλλήλους στους τομείς ναυτιλιακής πολιτικής, ναυτικής εκπαίδευσης και εργασίας, επιθεωρήσεων πλοίων, λιμενικής πολιτικής και ναυτιλιακών επενδύσεων, πληροφορικής και οικονομικών με στελέχωση, θα έχει ως αποτέλεσμα τον "απεγκλωβισμό" μεγάλου αριθμού ένστολου προσωπικού, το οποίο θα ασχοληθεί με τα κύρια στρατιωτικά καθήκοντά του και το οποίο λείπει από τις περιφερειακές μονάδες σύμφωνα και με δηλώσεις του ίδιου του υπουργού. Σε εντελώς αντίθετη κατεύθυνση κινείται το Π.Δ. αναφορικά με τον Οργανισμό του υπουργείου, καθώς, σύμφωνα με τον ΠΣΥΥΕΝ, το αποτέλεσμα είναι "ένα γραφειοκρατικό, αντιπαραγωγικό μοντέλο οργάνωσης του υπουργείου χωρίς καινοτόμες προτάσεις σύγχρονης διοίκησης, αλλά επαναφοράς του Οργανισμού του 1999 σε δυσμενέστερη μορφή για τους πολιτικούς υπαλλήλους, δέσμιο των βαριδιών του παρελθόντος".
"Η επιλογή του υπουργού Μιλτιάδη Βαρβιτσιώτη για τη μετατροπή του ΥΝΑ σε στρατόπεδο δεν θα περάσει", καταλήγουν οι υπάλληλοι του υπουργείου.