Προκύπτουν σοβαρά ερωτήματα: Πρώτον, πώς γίνεται, ενώ η αντίδραση των αρχών ήταν άμεση, η ρύπανση να εκτείνεται σε τέτοια απόσταση; Ο διευθυντής του γραφείου του αρχηγού του Λιμενικού Σώματος, αρχιπλοίαρχος Αλέξανδρος Λαγουρός τόνισε ότι τα καύσιμα του πλοίου είναι πετρελαιοειδή και αυτά που διέρρευσαν κατά τη βύθιση του Αγία Ζώνη ΙΙ στη διάρκεια της νύχτας, όπου πέφτει η θερμοκρασία, καταδύονται κάτω από την επιφάνεια της θάλασσας και δεν είναι οπτικά παρατηρήσιμα. Την ημέρα, ωστόσο, που ανεβαίνει ο ήλιος, αναδύονται με τη ζέστη και μεταφέρονται με τα υπόγεια ρεύματα στις ακτογραμμές, συμπλήρωσε.
Το δεύτερο και σημαντικό ερώτημα προκύπτει από το γεγονός ότι το πλοίο δεν είχε υποχρέωση να παρακολουθείται από νηογνώμονα, καθώς κάτι τέτοιο δεν προβλέπεται από τη νομοθεσία για τα πλοία εσωτερικών πλώων. Αρκεί το πιστοποιητικό από το υπουργείο Εμπορικής Ναυτιλίας, από την Επιθεώρηση Εμπορικών Πλοίων. Μάλιστα, το Αγ. Ζώνη ΙΙ κατείχε αυτό το πιστοποιητικό, το οποίο ωστόσο είχε λήξει, αλλά είχε πάρει παράταση ισχύος για δύο μήνες, κάτι που επίσης προβλέπεται νομοθετικά.
Όπως αναφέρουν γνωρίζοντες τα πράγματα της ναυτιλίας, παραδείγματα αντίστοιχων πλοίων υπάρχουν πολλά, πλοία κατασκευασμένα πολλές δεκαετίες πίσω, που μεταφέρουν καθημερινά πετρέλαιο και άλλα επικίνδυνα φορτία. Θα χρειαστεί άραγε ακόμη μεγαλύτερη περιβαλλοντική καταστροφή προκειμένου να τεθεί υπό συζήτηση το θεσμικό πλαίσιο χορήγησης πιστοποιητικών; Με ποιους όρους και με ποιους ελέγχους κρίνονται ως αξιόπλοα κουφάρια - κινητές "βόμβες";
Επιπλέον, σειρά επιστημόνων κάνουν λόγο για διάρκεια περισσότερη του ενός χρόνου προκειμένου να αποκατασταθεί η καταστροφή στον Σαρωνικό, ωστόσο κατά τη διάρκεια της χθεσινής ημέρας από επίσημα χείλη ειπώθηκε πως "σε 10-15 ημέρες" θα έχει επανέλθει η κατάσταση.
Πηγές από το υπουργείο Ναυτιλίας τονίζουν ότι η διαδικασία απορρύπανσης θα ολοκληρωθεί σε περίπου 25 ημέρες και τότε αναμένεται να αναλάβει δράση το Ελληνικό Κέντρο Θαλασσίων Ερευνών (ΕΛΚΕΘΕ) σε όλες τις περιοχές όπου υπήρξε απορρύπανση πετρελαιοειδών μετά τη βύθιση του δεξαμενόπλοιου και να λάβει δείγματα προκειμένου έπειτα από έλεγχο να πιστοποιήσει την ασφάλεια και την καθαρότητα των ακτών και της θάλασσας.
