Σε εξέλιξη βρίσκεται η δειγματοληψία στα χώματα, μετά από εντολή του εφέτη ανακριτή. που μεταφέρθηκαν σε ιδιωτικό οικόπεδο από το δυστύχημα στα Τέμπη
Τα χώματα μεταφέρθηκαν από το σημείο της σύγκρουσης των δύο αμαξοστοιχιών στα Τέμπη λίγα 24ωρα μετά το δυστύχημα, προκαλώντας την οργή των συγγενών των θυμάτων καθώς υπάρχουν καταγγελίες ότι μαζί με τα χώματα μεταφέρθηκαν ακόμα και οστά των θυμάτων.
Η αιφνίδια κίνηση να μεταφερθούν τα χώματα προκαλεί και σοβαρά ερωτήματα για τα καίρια στοιχεία που μπορεί να έχουν διαφύγει από την έρευνα για τη διερεύνηση του δυστυχήματος και που θα μπορούσαν να δώσουν απαντήσεις για το ξυλόλιο, ουσία που χρησιμοποιείται για τη νοθεία καυσίμων.
Να σημειωθεί ότι εφέτης ανακριτής Σωτήρης Μπακαΐμης φέρεται να έχει ζητήσει από την Χημική Υπηρεσία να προχωρήσει σε διενέργεια ελέγχου στους όγκους χωμάτων που μετέφερε εταιρεία χωματουργικών μηχανημάτων κατά την εκτέλεση εργασιών πρόσβασης γερανών στον τόπο της σιδηροδρομικής τραγωδίας των Τεμπών.
Επισημαίνεται ότι ο δικηγόρος οικογενειών των θυμάτων, Γιάννης Μαρακάκης, κατήγγειλε ότι «προ του μπαζώματος υπήρξε αφαίρεση τουλάχιστον 300 κ.μ. χώματος , που μπορεί να είχε μέσα τα υλικά που ψάχνουμε, ανθρώπινα μέλη, αποδεικτικά στοιχεία που ποτέ δεν αποτέλεσαν αντικείμενο έρευνας».