Μπορεί το αιματηρό επεισόδιο της επίθεσης των ισραηλινών κομάντο στο πλοίο Μαβί Μπαρμαρά στα τέλη Μαΐου του 2010, να σηματοδότησε τη ρήξη στις σχέσεις Ισραήλ - Τουρκίας, ωστόσο αυτές δεν ήσαν απολύτως ανέφελες μέχρι τότε.
Στις 27 Δεκεμβρίου 2008, το Ισραήλ εξαπέλυσε στρατιωτική επιχείρηση κατά της Λωρίδας της Γάζας. Την επομένη, ο Ερντογάν, ανακοίνωνε το πάγωμα των επαφών με το Ισραήλ, καταγγέλλοντας ένα «σοβαρό έγκλημα κατά της ανθρωπότητας».
Την 1ηΙανουαρίου 2009, ο Ερντογάν εγκατέλειπε οργισμένος μια δημόσια συζήτηση στο Παγκόσμιο Οικονομικό Φόρουμ στο Νταβός, αφού ήλθε σε ρήξη με τον Ισραηλινό πρόεδρο Σιμόν Πέρες σχετικά με τη Γάζα. «Σκοτώνετε τον κόσμο» είχε πει ο Τούρκος πρωθυπουργός, απευθυνόμενος στον Πέρες.
Στις 11 Ιανουαρίου του 2010 ο αναπληρωτής ΥΠΕΞ του Ισραήλ, Ντάνι Αγιαλόν και ο πρέσβης της Τουρκίας στο Ισραήλ, Αχμέτ Ογκούτς Τσελικόλ συναντιόνταν, με την ισραηλινή πλευρά να επιχειρεί να υποβαθμίσει τον Τούρκο διπλωμάτη. Ο Αγιαλόν έβαλε τον Τσελικόλ να καθίσει σε χαμηλότερη καρέκλα από εκείνες των ισραηλινών διπλωματών, και κάλεσε τους φωτογράφους να απαθανατίσουν τη σκηνή...
Μετά το περιστατικό του Μαβί Μαρμαρά, η Τουρκία αποκάλεσε το Ισραήλ «κράτος – τρομοκράτη» και ανακάλεσε τον πρέσβη της.
Την 1ηΣεπτεμβρίου του 2011, η Επιτροπή Πάλμερ του ΟΗΕ, που διερεύνησε το περιστατικό, αποκάλυψε ότι οι ισραηλινοί κομάντος συνάντησαν «οργανωμένη και βίαιη αντίσταση από ομάδα των επιβατών» και «αναγκάστηκαν να προσφύγουν στην αυτοάμυνα».
Στις 2 Σεπτεμβρίου της ίδιας χρονιάς η Τουρκία ανακοίνωσε ότι υποβάθμισε τους διπλωματικούς της δεσμούς με το Ισραήλ, φθάνοντας στο χαμηλότερο επίπεδο, απελαύνοντας τον πρέσβη του από τη χώρα.
Στις 12 Νοεμβρίου 2012 οι δύο χώρες ξανάρχισαν τις συνομιλίες για το τέλος της κρίσης.
22 Μαρτίου 2013: ο Νετανιάχου τηλεφωνά στον Ερντογάν και ζητά συγγνώμη για τον θάνατο των Τούρκων πολιτών. Η αποκατάσταση περιλαμβάνει την επιστροφή του Τούρκου πρέσβη στο Τελ Αβίβ και του Ισραηλινού συναδέλφου του στην Άγκυρα.
