Στη θέση της για διατήρηση του «ορθόδοξου χαρακτήρα» του μαθήματος των Θρησκευτικών, όπως την έχει εκφράσει ο αρχιεπίσκοπος Ιερώνυμος, εμμένει η Διαρκής Ιερά Σύνοδος της Εκκλησίας της Ελλάδος, σύμφωνα με σχετική ανακοίνωσή της. Παράλληλα, η ΔΙΣ τάχθηκε υπέρ της υποχρεωτικότητας του μαθήματος των Θρησκευτικών και της τήρησης των ωρών διδασκαλίας του στο τρέχον πρόγραμμα σπουδών.
Η Διαρκής Ιερά Σύνοδος επανήλθε και στο ζήτημα της πρωινής προσευχής στα σχολεία, επαναλαμβάνοντας προς γονείς και εκπαιδευτικούς ότι η πρωινή προσευχή προβλέπεται νομικά από το άρθρο 13, παράγραφος 5, εδάφιο α του Προεδρικού Διατάγματος 201/1998 (ΦΕΚ Α’ 161/1998). Η ΔΙΣ αποφάσισε ακόμα να στείλει εγκύκλιο σημείωμα στις μητροπόλεις προκειμένου να τις ενημερώσει για το «προκύψαν θέμα» της πρωινής προσευχής στα σχολεία.
