Ρύθμιση για τη χορήγηση άδειας διαμονής σε μετανάστες για ανθρωπιστικούς λόγους, με την "επίμαχη" διάταξη ότι τίθενται σε καθεστώς προστασίας θύματα και μάρτυρες ρατσιστικής βίας, πήρε αριθμό ΦΕΚ λίγες μέρες πριν τον ανασχηματισμό με τις υπογραφές των υπουργών Δικαιοσύνης Χαρ. Αθανασίου και Δημοσίας Τάξεως Ν. Δένδια, του υφυπουργού Εργασίας Β. Κεγκέρογλου και του Λεων. Γρηγοράκου ως αναπληρωτή υπουργού Εσωτερικών.
Η διάταξη είχε αποσυρθεί μετά την παρέμβαση Μπαλτάκου από τον Κώδικα Μετανάστευσης, επανήλθε όμως ως Κοινή Υπουργική Απόφαση την 5η Ιουνίου και προβλέπει ότι χορηγείται άδεια παραμονής για θύματα και μάρτυρες ρατσιστικής βίας εφόσον έχει διαταχθεί προκαταρκτική εξέταση ή έχει ασκηθεί ποινική δίωξη και μέχρι να τεθεί η υπόθεση στο αρχείο ή να τελεσιδικήσει. Προβλέπεται ότι "εάν υποβάλλονται σε θεραπευτική αγωγή, η άδεια διαμονής εξακολουθεί να χορηγείται για όσο χρονικό διάστημα διαρκεί η θεραπεία τους. Η διάρκεια της αρχικής άδειας διαμονής είναι ετήσια, παρέχει δικαίωμα εξαρτημένης εργασίας παροχής υπηρεσιών ή έργου και μπορεί να ανανεώνεται κάθε φορά μέχρι δύο έτη εφόσον πληρούνται οι ίδιες προϋποθέσεις". Στην ίδια κατηγορία εμπίπτουν και τα θύματα σωματεμπορίας "εφόσον υφίσταται σχετική πράξη χαρακτηρισμού από τον εισαγγελέα Πρωτοδικών".
Επίσης, άδεια παραμονής για ανθρωπιστικούς λόγους παρέχεται σε μετανάστες που είναι θύματα ενδοοικογενειακής βίας, που απασχολήθηκαν με καταχρηστικούς όρους, πάσχοντες με σοβαρά προβλήματα υγείας, για όσους απορρίπτεται η αίτηση για διεθνή προστασία, αλλά η υπόθεσή τους παραπέμπεται στο υπουργείο Εσωτερικών και για γονείς ανήλικων ημεδαπών.
Με απόφαση του Γ.Γ. Αποκεντρωμένης Διοίκησης χορηγείται άδεια παραμονής για ανθρωπιστικούς λόγους σε ανήλικους που χρήζουν προστατευτικών μέτρων και φιλοξενούνται από ιδρύματα ή άλλα νομικά πρόσωπα κοινωφελούς σκοπού, σε ανήλικους που η επιμέλεια με δικαστική απόφαση έχει ανατεθεί σε οικογένεια Ελλήνων ή αλλοδαπών. Το ίδιο συμβαίνει για θύματα εργατικών ατυχημάτων και λοιπών ατυχημάτων που καλύπτονται από την ελληνική νομοθεσία, καθώς και για όσους φοίτησαν επί τουλάχιστον έξι τουλάχιστον έτη σε ελληνικό σχολείο, μέχρι τη συμπλήρωση του 21ου έτους της ηλικίας τους, εφόσον η φοίτησή τους ήταν επαρκής και εξακολουθούν να διαμένουν μόνιμα στη χώρα.
