Οι αρμοδιότητες για την προστασία των δασικών οικοσυστημάτων, του φυσικού και ατμοσφαιρικού περιβάλλοντος, των υδάτων και της διαχείρισης των αποβλήτων ανατίθενται, σύμφωνα με την απόφαση του πρωθυπουργού Αλ. Τσίπρα (ΦΕΚ Β 3722/17 Νοεμβρίου), στον αναπληρωτή υπουργό Περιβάλλοντος και Ενέργειας Σ. Φάμελλο.
Ειδικότερα ο αναπληρωτής υπουργός αναλαμβάνει τις αρμοδιότητες της Γενικής Διεύθυνσης Περιβαλλοντικής Πολιτικής της Γενικής Γραμματείας του υπουργείου Περιβάλλοντος και Ενέργειας με το σύνολο των τμημάτων και υπηρεσιών που υπάγονται σε αυτή. Η εν λόγω γενική διεύθυνση συγκροτείται από τρεις διευθύνσεις. Αυτές είναι: Περιβαλλοντικής Αδειοδότησης, Βιοποικιλότητας - Εδάφους - Διαχείρισης Αποβλήτων και Κλιματικής Αλλαγής - Ποιότητας Ατμόσφαιρας. Επιπλέον της Γενικής Διεύθυνσης Ανάπτυξης και Προστασίας Δασών και Αγροπεριβάλλοντος και της Ειδικής Γραμματείας Υδάτων.
Ο Σ. Φάμελλος εποπτεύει τους φορείς: Εθνικό Κέντρο Περιβάλλοντος και Αειφόρου Ανάπτυξης (ΕΚΠΑΑ), Διαχείρισης Προστατευόμενων Περιοχών και τον Ελληνικό Οργανισμό Ανακύκλωσης. Από κοινού με τον υπουργό Γ. Σταθάκη ασκούνται οι αρμοδιότητες της Διεύθυνσης Διεθνών και Ευρωπαϊκών Δραστηριοτήτων όπως και της Διεύθυνσης Σχεδίων Προστατευόμενων Περιοχών Θαλάσσιου Χώρου και Δασικών Χαρτών, η οποία ανήκει στη δεύτερη Γενική Γραμματεία του υπουργείου, Χωρικού Σχεδιασμού και Αστικού Περιβάλλοντος.
Συναρμοδιότητα προβλέπεται και για την επιτελική δομή, που συνδέεται με τη διαχείριση των Προγραμμάτων Περιβάλλοντος του ΕΣΠΑ, όπως και του Σώματος Επιθεώρησης Περιβάλλοντος, Δόμησης, Ενέργειας και Μεταλλείων. Από κοινού ασκείται επίσης η εποπτεία του Πράσινου Ταμείου, του Μητροπολιτικού Φορέα Ανάπλασης και Διαχείρισης Προστατευόμενων Περιοχών Αττικής (αφορά την περιοχή του Ελαιώνα και τον ποταμό Κηφισό) και του Φορέα Διαχείρισης Μητροπολιτικού Πάρκου Περιβαλλοντικών και Εκπαιδευτικών Δραστηριοτήτων και Ανάπτυξης Κοινωνικής Οικονομίας «Αντώνης Τρίτσης».
Όπως προκύπτει από την απόφαση ανάθεσης των αρμοδιοτήτων, ο υπουργός Γ. Σταθάκης, εκτός από τον τομέα της "ενέργειας και των ορυκτών πρώτων υλών", είναι αρμόδιος και για τον χωροταξικό και πολεοδομικό σχεδιασμό.