Σε απόρρητα κριτήρια ανάλυσης κινδύνων θα στηρίζεται το αυτοματοποιημένο μοντέλο αξιολόγησης των προς έλεγχο φορολογικών υποθέσεων. Με βάση οδηγίες που έστειλε ο διοικητής της ΑΑΔΕ Γεώργιος Πιτσιλής στις φορολογικές αρχές, από το σύνολο των εκκρεμών υποθέσεων κάθε ελεγκτικής υπηρεσίας ελέγχονται, κατά προτεραιότητα, οι υποθέσεις με την υψηλότερη σχετική μοριοδότηση, ακολουθώντας φθίνουσα σειρά ταξινόμησης ώς την επίτευξη της ετήσιας στοχοθεσίας κάθε υπηρεσίας βάσει του Επιχειρησιακού Σχεδίου του 2017. Και με τήρηση της προβλεπόμενης αναλογίας ελέγχων/υποθέσεων που αφορούν την τελευταία πενταετία και προγενέστερα (60% έναντι 40% αντίστοιχα).
Σε κάθε περίπτωση κάλυψης των στόχων του επιχειρησιακού σχεδίου, διενεργούνται έλεγχοι υποθέσεων επιπλέον των στόχων, σύμφωνα με τη φθίνουσα σειρά ταξινόμησης. Οι προϊστάμενοι των ελεγκτικών υπηρεσιών, εφόσον από διαθέσιμα στοιχεία ή πληροφορίες κρίνουν ότι συντρέχει βάσιμος λόγος ελέγχου κατά προτεραιότητα υποθέσεων μη προτεραιοποιημένων, υποχρεούνται εντός 20 εργάσιμων ημερών από την ανάρτηση των προτεραιοποιημένων υποθέσεων της υπηρεσίας τους να εισάγουν την προκρινόμενη υπόθεση σε σειρά κατάταξης ανάλογα με τη σημαντικότητά της, συνεκτιμώντας και τη σοβαρότητα των υποθέσεων που ανακατατάσσονται.
Ανεξάρτητα από τις προτεραιοποιημένες υποθέσεις προς έλεγχο, ολοκληρώνονται άμεσα υποθέσεις που αφορούν εκθέσεις των ΥΕΔΕΕ, επιστροφές φόρων, εκδοθέν σημείωμα διαπιστώσεων με τα αποτελέσματα του φορολογικού ελέγχου και προσωρινό προσδιορισμό φόρων και προστίμων ώς τώρα, επικείμενη έκδοση σημειώματος διαπιστώσεων και προσωρινού προσδιορισμού φόρου και προστίμου, διενέργεια μερικού επιτόπιου ελέγχου διαπίστωσης της εκπλήρωσης των φορολογικών υποχρεώσεων, τήρησης βιβλίων και έκδοσης φορολογικών στοιχείων για φορολογούμενους που ασκούν οποιαδήποτε δραστηριότητα ή διακινούν αγαθά, για τις οποίες εκκρεμεί σύνταξη εκθέσεων ελέγχου ή/και η έκδοση πράξεων και διασταυρωτικούς ελέγχους ενδοκοινοτικών συναλλαγών (VIES), υποθέσεις πολυμερών (ταυτόχρονων) ελέγχων που διενεργούνται από ελληνικές και αλλοδαπές φορολογικές αρχές, διενέργεια ελέγχου στο πλαίσιο επανάληψης διαδικασίας καθώς και σε εκτέλεση προδικαστικής απόφασης.
Η Διεύθυνση Ελέγχων μπορεί να διαβιβάζει δείγμα υποθέσεων που έχουν προτεραιοποιηθεί από τους προϊσταμένους των ελεγκτικών υπηρεσιών, το οποίο δεν μπορεί να υπερβεί συνολικά το 5% αυτών, στη Διεύθυνση Εσωτερικών Υποθέσεων για τις δικές της ενέργειες κατά λόγο αρμοδιότητας.
