Ποινική δίωξη για απιστία με τις επιβαρυντικές διατάξεις του νόμου περί καταχραστών του Δημοσίου ασκήθηκε εις βάρος του πρώην γενικού γραμματέα Οικονομικού Σχεδιασμού και Αμυντικών Επενδύσεων του υπουργείου Εθνικής Άμυνας Σπύρου Τραυλού και άλλων δέκα προσώπων που διετέλεσαν μέλη της επιτροπής διαπραγματεύσεων. Η υπόθεση αφορά τη σύμβαση 010Β/03/6.2.2003 για τον εκσυγχρονισμό μέσης ζωής 6 φρεγατών τύπου "S" του Πολεμικού Ναυτικού, ενώ η δικογραφία διαβιβάστηκε στη Βουλή προκειμένου να διερευνηθούν τυχόν ευθύνες τού τότε υπουργού Εθνικής Άμυνας Γιάννου Παπαντωνίου.
Η σύμβαση που υπογράφηκε ήταν ύψους 380 εκατομμυρίων ευρώ, ποσό που μετά τις αναπροσαρμογές ανήλθε σε 480 εκατομμύρια ευρώ. Όπως προέκυψε από την εισαγγελική έρευνα για το χρηματοδοτικό κενό που προέκυψε, δηλαδή για τις μίζες που απαιτήθηκαν, παραχωρήθηκαν στην εταιρεία ευμενέστεροι όροι ως ανταλλάγματα. Το αποτέλεσμα ήταν να επέλθει ζημιά στο Δημόσιο που ξεπερνάει τα 31 εκατομμύρια ευρώ, από τα οποία περισσότερα από 23 εκατομμύρια ευρώ έχουν ήδη καταβληθεί!
Η σύμβαση είχε δρομολογηθεί ήδη από το 2001 επί υπουργίας Τσοχατζόπουλου, ωστόσο στην πορεία έγινε αντιληπτό ότι δεν επαρκούσαν οι διαθέσιμες πιστώσεις. Για τον λόγο αυτόν η Διεύθυνση Εξοπλισμών του ΓΕΝ και ο τότε Α/ΓΕΝ Αντώνιος Αντωνιάδης τάχθηκαν κατά της υλοποίησης του προγράμματος, με το σκεπτικό ότι οι διαθέσιμες πιστώσεις επαρκούσαν μόνο για περιορισμένες βελτιώσεις στα ηλεκτρονικά συστήματα των πλοίων και όχι στην αναβάθμιση της αντιαεροπορικής και αντιπυραυλικής άμυνάς τους, όπως επιθυμούσε το Πολεμικό Ναυτικό. Προβληματικό ήταν επίσης και το χρονοδιάγραμμα υλοποίησης της σύμβασης που ήταν υπερβολικά εκτεταμένο, φτάνοντας μέχρι το 2010, όταν δηλαδή τα πλοία θα είχαν υπερβεί το 30ό έτος της ηλικίας τους.
Παρ' όλα αυτά, η ηγεσία του υπουργείου Εθνικής Άμυνας και της Γενικής Γραμματείας Οικονομικού Σχεδιασμού και Αμυντικών Επενδύσεων επέμειναν μέχρι τέλους στην υπογραφή της σχετικής σύμβασης και την υλοποίηση του προγράμματος εκσυγχρονισμού. Οι τελικές υπογραφές μπήκαν το 2003 από τον Γιάννο Παπαντωνίου, ο οποίος υπέγραψε την απόφαση κατακύρωσης του προγράμματος.
ΕΙΡ.ΛΑΖ. - Ν.ΠΑΠ.