Τη συμπαράστασή της στον υπουργό Παιδείας Ν. Φίλη εκφράζει η Π.Γ. του ΣΥΡΙΖΑ, καταδικάζοντας παράλληλα τις πράξεις βίας κατά του βουλευτή της Ν.Δ., Γ. Κουμουτσάκου. Όπως επισημαίνεται σε σχετική ανακοίνωση, οι προσωπικές απόψεις που εξέφρασε ο Νίκος Φίλης, αναφερόμενος σε παλιό άρθρο του, σχετικά με τη διάκριση μεταξύ "αιματηρής εθνοκάθαρσης" και "γενοκτονίας" των Ποντίων ξεσήκωσαν έναν ορυμαγδό εθνικιστικών δηλώσεων, στο πλαίσιο μιας μικροπολιτικής προσπάθειας πατριδοκαπηλίας.
Οι επιθέσεις στον υπουργό Παιδείας δεν προέρχονται μόνο από τη Ν.Δ., αλλά και από βουλευτές και στελέχη άλλων κομμάτων. Η Π.Γ. του ΣΥΡΙΖΑ καταδικάζει αυτές τις επιθέσεις, που εξελίχθηκαν και σε πράξεις βίας κατά του βουλευτή του Κοινοβουλίου κ. Κουμουτσάκου από ακροδεξιά στοιχεία και εκφράζει τη συμπαράστασή της στον Νίκο Φίλη.
Απειλή για την ελεύθερη έκφραση και την επιστημονική έρευνα χαρακτηρίζει το Τμήμα Δικαιωμάτων του ΣΥΡΙΖΑ τη μισαλλόδοξη επίθεση κατά του Ν. Φίλη. «Υπάρχουν μερικά πράγματα αδιαπραγμάτευτα: ο σεβασμός του πόνου των θυμάτων και των απογόνων τους, ο σεβασμός της μνήμης, η αναγνώριση του εγκλήματος που διαπράχθηκε εναντίον των Ποντίων, το δικαίωμα στην ελεύθερη επιστημονική έρευνα και δημόσια συζήτηση. Σε αυτό το πλαίσιο, αν το έγκλημα της σφαγής των Ποντίων πρέπει να χαρακτηριστεί 'γενοκτονία' ή 'εθνοκάθαρση' πρέπει να αποτελεί αντικείμενο ελεύθερης και τεκμηριωμένης συζήτησης μεταξύ ιστορικών, επιστημόνων και πολιτικών και όχι κάποια προαποφασισμένη αλήθεια, η αμφισβήτηση της οποίας θεωρείται βέβηλη» τονίζεται σε σχετική ανακοίνωση και επισημαίνεται ότι: Η υπεράσπιση του υπουργού Παιδείας δεν είναι υπεράσπιση ενός προσώπου, είναι υπεράσπιση των όρων του ελεύθερου δημοκρατικού και επιστημονικού διαλόγου.
Σχολιάζοντας το Τμήμα Δικαιωμάτων του ΣΥΡΙΖΑ τον άγριο ξυλοδαρμό του βουλευτή της Ν.Δ., Γ. Κουμουτσάκου, επισημαίνει ότι «μας θυμίζει με τον πιο άμεσο και οδυνηρό τρόπο πώς, μέσα στο κλίμα μισαλλοδοξίας και στο κυνήγι μαγισσών, οι νεοναζί βρίσκουν πρόσφορο έδαφος. Το Τμήμα Δικαιωμάτων του ΣΥΡΙΖΑ καταδικάζει απερίφραστα την επίθεση και συμπαραστέκεται στον Γ. Κουμουτσάκο γιατί η συμπαράσταση, και εδώ, δεν αφορά ένα πρόσωπο, αλλά τη δημοκρατία. Την ίδια ώρα επισημαίνει ότι είναι εξαιρετικά επικίνδυνο, θλιβερό και ανήκουστο να υποδεικνύεται ως «ηθικός αυτουργός» της επίθεσης ο υπουργός Παιδείας.
Την επίθεση εις βάρος του Ν. Φίλη καταδικάζει και ο Μιχάλης Σταθόπουλος, πρώην υπουργός Δικαιοσύνης και πρώην πρύτανης του Πανεπιστημίου Αθηνών. Μιλώντας σε ραδιοφωνικό σταθμό της Θεσσαλονίκης ο κ. Σταθόπουλος τόνισε ότι δεν είναι δουλειά ενός νομοθέτη να κάνει τον ιστορικό και να μας πει τι έγινε και τι δεν έγινε στον Πόντο. «Πώς να μας πει μια απόφαση της Βουλής να σταματήσει την ιστορική έρευνα και να φιμώσει την ελευθερία του επιστημονικού λόγου;" δήλωσε χαρακτηριστικά ο Μ. Σταθόπουλος.
Επίσης τόνισε ότι ο αντιρατσιστικός νόμος δεν μπορεί να απαγορεύσει την ελευθερία της έρευνας και την ελευθερία έκφρασης της γνώμης, αν είχε αυτή την πρόθεση, που δε νομίζω να είχε, θα ήταν αντισυνταγματικό. Αναφερόμενος στον Ν. Φίλη τον οποίο, όπως είπε, γνώριζε από φοιτητή, τον χαρακτήρισε μετριοπαθή και συνετό αριστερό.