Ελάχιστοι φορολογούμενοι βρίσκουν το δίκιο τους προσφεύγοντας στη Διεύθυνση Επίλυσης Διαφορών του υπουργείου Οικονομικών για ακύρωση εις βάρος τους αποφάσεων των φορολογικών αρχών τις οποίες θεωρούν άδικες. Με βάση στοιχεία της Γενικής Γραμματείας Δημοσίων Εσόδων, από τις 7.247 ενδικοφανείς προσφυγές που υποβλήθηκαν στη Διεύθυνση Επίλυσης Διαφορών από 1ης Σεπτεμβρίου 2013 έως 30ή Σεπτεμβρίου 2014 έγιναν δεκτές εν όλω ή εν μέρει μόλις 846, δηλαδή ποσοστό 11,67%. Οι υπόλοιπες 6.401 (το 88,33%) είτε απορρίφθηκαν είτε δεν έχουν ακόμη εξεταστεί.
Σύμφωνα με τα ίδια στοιχεία, από την 1η Σεπτεμβρίου 2013, οπότε λειτούργησε πρώτη φορά η Διεύθυνση Επίλυσης Διαφορών (αρχικά ως «Υπηρεσία Εσωτερικής Επανεξέτασης») έως την 30ή Σεπτεμβρίου 2014:
* Παραπέμφθηκαν 9.263 υποθέσεις, εκ των οποίων οι 7.247 ήταν ενδικοφανείς προσφυγές κατά αποφάσεων της φορολογικής διοίκησης (εκκαθαριστικών σημειωμάτων επιβολής φόρων, εκθέσεων καταλογισμού φόρων, πράξεων επιβολής προστίμων κ.λπ.) και οι υπόλοιπες 2.016 ήταν αιτήσεις για την αναστολή της καταβολής του 50% των φόρων και των προστίμων ενόψει εκδίκασης ενδικοφανούς προσφυγής.
* Από τις 7.247 ενδικοφανείς προσφυγές ολοκληρώθηκαν οι διαδικασίες για τις 5.991, ενώ οι υπόλοιπες 1.256 βρίσκονται ακόμη σε εκκρεμότητα.
* Από τις 5.991 ενδικοφανείς προσφυγές για τις οποίες ολοκληρώθηκαν οι διαδικασίες, οι 846 έγιναν δεκτές εν μέρει ή εν όλω, οι 2.480 απορρίφθηκαν με απόφαση, ενώ οι υπόλοιπες 2.665 απορρίφθηκαν σιωπηρά, δηλαδή η προβλεπόμενη από τον νόμο προθεσμία των 60 ημερών για την εξέτασή τους εξέπνευσε χωρίς να ληφθεί απόφαση.
