Το Εθνικό Κέντρο Επιχειρήσεων Υγείας (ΕΚΕΠΥ) ορίστηκε ως ο επικεφαλής συντονιστικός φορέας όλων των προσπαθειών για την αποτελεσματική υγειονομική κάλυψη των προσφύγων, κυρίως στον Πειραιά, στο Ελληνικό και στην πλατεία Βικτωρίας.
Για τον επιχειρησιακό σχεδιασμό πραγματοποιήθηκε στο ΕΚΕΠΥ ευρεία σύσκεψη με τη συμμετοχή του Γενικού Γραμματέα Δημόσιας Υγείας και όλων των κρατικών φορέων, ΜΚΟ και εθελοντών που δραστηριοποιούνται υγειονομικά σε χώρους μεγάλης συγκέντρωσης προσφύγων και μεταναστών στην Αττική.
«Ότι το υπουργείο αναλαμβάνει να συντονίσει δεν σημαίνει ότι θα αρνηθούμε ή θα υποκαταστήσουμε οποιονδήποτε. Θα δεχθούμε τη βοήθεια, γιατί την έχουμε ανάγκη, αλλά θα τη συντονίσουμε» σημείωσε κατά τη διάρκεια της σύσκεψης ο γ.γ. Δημόσιας Υγείας Γ. Μπασκόζος.