Σημαντική αύξηση παρουσίασε η κερδοφορία των μεγαλύτερων περιφερειακών λιμανιών της χώρας, που λειτουργούν με τη μορφή της Α.Ε. Σύμφωνα με τα σχετικά στοιχεία του Ταμείου Ιδιωτικοποιήσεων, ο μέσος όρος αύξησης των κερδών των εννέα Οργανισμών Λιμένων (χωρίς την Πάτρα, που είχε μεγάλες ζημίες το 2015 λόγω διαγραφών παγίων), με βάση τα Διεθνή Λογιστικά Πρότυπα (ΔΛΠ) έφτασε το 112%.
Ο μέσος όρος των 10 Οργανισμών Λιμένων μαζί με την Πάτρα φτάνει 1227%. Αξίζει να σημειωθεί ότι το λιμάνι της Πάτρας έκλεισε με μικρά κέρδη το 2016, ωστόσο η τόσο μεγάλη διαφορά σε σχέση με το 2015 προκύπτει από λογιστικές εγγραφές παγίων στοιχείων, εξαιτίας των οποίων ο Οργανισμός παρουσίασε ζημία 12,384 εκατ. ευρώ.
Σε επίπεδο κύκλου εργασιών, έξι λιμάνια (Βόλος, Ελευσίνα, Καβάλα, Κέρκυρα, Ραφήνα, Αλεξανδρούπολη) καταγράφουν θετικό πρόσημο για το 2016, ενώ τέσσερα στα δέκα λιμάνια παρουσίασαν πέρυσι μείωση του κύκλου εργασιών. Εντύπωση η μεγάλη αύξηση εξόδων που παρουσιάζουν ορισμένα από τα περιφερειακά λιμάνια, με “μπροστάρη” τον Οργανισμό Λιμένος Βόλου (30%).